Công tác tu sửa – phục chế
Song song cùng các hoạt động chuyên môn khác, từ những ngày đầu thành lập Bảo tàng đã chú trọng tới công tác tu sửa bảo quản dù trong điều kiện cơ sở vật chất còn nghèo nàn, thiếu thốn. Suốt mấy chục năm qua các thế hệ làm công tác tu sửa phục chế của Bảo tàng đã đạt được một số kết quả. Tuy nhiên trong 2 năm trở lại đây (2004-2005) công tác tu sửa phục chế mới thực sự được khuấy động và hoạt động mạnh mẽ trở lại.

Tu sửa bảo quản các tác phẩm sơn dầu:
Khởi đầu là việc tu sửa tác phẩm “Em Thúy” của danh họa Trần Văn Cẩn do tổ chức ASIALINK tài trợ và người thực hiện là một chuyên gia người Úc – bà Caroline Fry đảm nhiệm đã gây tiếng vang lớn. Với sự hướng dẫn của chuyên gia Úc, các cán bộ tu sửa phục chế đã khảo sát đánh giá tình trạng các tác phẩm sơn dầu, lập kế hoạch bảo quản định kỳ. Phần lớn các tác phẩm sơn dầu trên trưng bày đã được bảo quản. Và mới đây thông qua việc hợp tác liên kết với Đại học Đức Dresden trong công tác phục chế, thêm 02 tác phẩm sơn dầu được đưa sang Đức tu sửa cùng với 2 cán bộ đi cùng để học hỏi kinh nghiệm. Đây là một bước tiếng mới đáng kể cần đẩy mạnh hơn nữa

Tu sửa bảo quản các tác phẩm sơn mài:
Sơn mài là một ngành mỹ thuật truyền thống của Việt Nam, đây cũng là thế mạnh của các cán bộ tu sửa phục chế Bảo tàng Mỹ thuật Việt Nam. Để thực hiện các công tác tu sửa, bộ phận tu sửa các tác phẩm sơn mài đã thực hiện công tác khảo sát đánh giá tình trạng hiện vật ở khu trưng bày và ở trong kho theo các cấp độ khác nhau, sau đó đưa ra các phương án tu sửa trình Hội đồng Khoa học để lựa chọn phương án tối ưu nhất.

Trong 2 năm trở lại đây các họa sĩ tổ tu sửa phục chế các tác phẩm sơn mài đã hoàn thành 11 tác phẩm. Phần lớn các tác phẩm đều bị hư hại nặng. Tiêu biểu như tác phẩm “Hội mùa” của tác giả Nguyễn Như Hoành

Công tác tu sửa phục chế được thực hiện khoa học và cẩn trọng, các tác phẩm sau khi hoàn thành đều được lập hồ sơ khoa học với đầy đủ thông tin, hình ảnh, phương án tu sửa từ khi bắt đầu đến kết thúc công việc. Với sự nhiệt tình và nỗ lực tìm kiếm các nguồn tài trợ của Giám đốc Bảo tàng Mỹ thuật Việt Nam cho công tác tu sửa phục chế, tháng 10 năm 2005 Bảo tàng được tiếp nhận nguồn tài trợ từ Đại sứ quán Mỹ cho công tác tu sửa 02 tác phẩm sơn mài “Nam Bắc một nhà” của tác giả Nguyễn Văn Tỵ và tác phẩm “Hội chùa” của tác giả Lê Quốc Lộc.

Tu sửa phục chế các tác phẩm điêu khắc:
Phần lớn các tác phẩm điêu khắc được lưu giữ tại Bảo tàng đều làm bằng chất liệu thạch cao, theo thời gian, thạch cao và các chất liệu tạo nên tác phẩm bị lão hóa, không còn bên vững. Xuất phát từ nhu cầu thực tế, lãnh đạo bảo tàng và bộ phận Tu sửa phục chế đã lập chương trình kế hoạch lâu dài cho công tác tu sửa, chuyển đổi chất liệu cho các hiện vật thạch cao sang chất liệu bền vững với mục đích giữ gìn giá trị của tác phẩm, phục vụ công tác trưng bày, triển lãm lưu động và các hoạt động chuyên môn khác. Quá trình thực hiện công tác, tu sửa, chuyển đổi chất liệu cho tác phẩm được Hội đồng khoa học góp ý, nghiệm thu qua từng giai đoạn để hiện vật phiên bản đạt được hiệu quả sát với bản gốc. Trong thời gian qua đã tu sửa phục chế được hàng chục tác phẩm, chuyển đồi chất liệu nhiều hiện vật điêu khắc cổ như: 18 vị La Hán chùa Tây phương, các điêu khắc dân gian đình làng.

Tu sửa phục chế các tác phẩm tranh giấy, lụa:
Các tác phẩm tranh giấy, lụa chiếm số lượng đáng kể trong sưu tập hội họa. Qua khảo sát đánh giá hiện trạng các tác phẩm ở khu trưng bày và trong kho, Bảo tàng đã có kế hoạch, phương án tu sửa cho các tác phẩm. Với phương châm vừa làm vừa nghiên cứu tìm các phương pháp xử lý, đúc rút kinh nghiệm, các họa sĩ tu sửa phục chế tranh giấy lụa đã tu sửa cho từng tác phẩm tùy theo tình trạng và triển khai công việc với thái độ cẩn trọng nghiêm túc. Trong 2 năm qua tổ tu sửa tranh giấy, lụa đã tu sửa được 14 tác phẩm lụa, bồi và phiên bản hàng chục tranh giấy cổ được Hội đồng khoa học của Bảo tàng nghiệm thu.